Polimorfisme Kloroplas Genom pada Lima Family Tumbuhan untuk Kepentingan Informasi Identifikasi

Abstract

Informasi yang lengkap sangat diperlukan dalam mendukung upaya pemuliaan serta konservasi jenis berbagai tanaman termasuk informasi terkait keanekaragaman genetik yang masih belum banyak dilakukan. Uji keanekaragaman genetik memerlukan primer yang mampu untuk mendeteksi keberadaan alel dalam suatu genotipe seperti primer genom kloroplas. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi jenis primer genom kloroplas pada beberapa DNA dari beberapa family  yang diharapkan dapat digunakan untuk dijadikan rekomendasi primer yang dapat digunakan untuk identifikasi spesies yang belum jelas secara genetik. Sampel yang digunakan sebanyak 30 sampel DNA dari 5 family yang berbeda yakni dari family Euphorbiace, Arecaceae, Poaceae, Rubiaceae, dan Dipterocarpaceae. Penelitian ini penanda genom kloroplas (rbcL dan matK) DNA. Pengujian pada beberapa sampel dari family Euphorbiace, Arecaceae, Poaceae, Rubiaceae, dan Dipterocarpaceae menunjukkan bahwa tingkat keberhasilan primer genom kloroplas pada penanda rbcL lebih tinggi 0,12% dibandingkan dengan penanda matK. Primer genom kloroplas pada penanda matK dan rbcL yang mampu mengamplifikasi sampel pada seleksi primer adalah matK 4, matK5, rbcL 1, rbcL 2, rbcL 3, dan rbcL 4 dengan masing-masing presentase sebesar 91,7%, 100%, 83,3%, 91,3%, 75%, dan 25%.